تحديد جزيرة الكوليباكتين في عزلة فريدة من Echerichia fergusonii معزولة من سرطان القولون والمستقيم

يُعد سرطان القولون والمستقيم ثاني أكثر أسباب الوفيات المرتبطة بالسرطان شيوعًا. في دراستنا الحالية، جُمعت 62 عينة بكتيرية معزولة من 55 خزعة من مرضى راجعوا قسم تنظير الجهاز الهضمي ومن عمليات جراحية.  كان النصيب الاكبر من هذه الخزع من مرضى القولون والمستقيم، والعدد الاقل من الخزع من نصيب مرضى المعدة. ومن الجدير بالذكر ان 11 خزعة من القولون والمستقيم ومن المعدة لم تعطي نتيجة ايجابية عند زراعتها على الاوساط الزرعية. وأظهرت النتائج أن بكتريا   E. coli كانت الاكثر انتشارا بين العزلات السالبة لصبغة كرام المحصل عليها، اذ بلغت 46 عزلة من اجمالي العزلات البكترية.

تم الحصول على عينة من Echerichia fergusonii من امرأة مسنة مصابة بسرطان القولون وخضعت لعملية جراحية لإزالة الورم. تم التعرف على Echerichia fergusonii جزيئيًا باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل التقليدي، من بين العينات التي تحتوي على الجينات المشفرة للكوليباكتين (clbA.clbB,clbN,clbQ). وبالتالي، تُعتبر هذه أول عينة محلية وعالمية تحتوي على هذه الجينات. استُخدمت تسلسلات جينات16SrRNA لإثبات تشخيص Echerichia fergusonii، وقورنت بتسلسلات المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية NCBI).) تم تسجيل تسلسلات16SrRNA  في بنك الجينات، تحت رقم الدخول PV628355.1، ثم أُطلق على السلالة اسم IAA المختصر. تم رسم شجرة النشوء والتطور لتحديد العلاقة بين عزلة pv628355 وعزلات عراقية أخرى، وأظهرت النتيجة علاقة وثيقة بينها وبين IRQBAS114 LC647818